Rafa Márquez abandonó el cargo de entrenador principal del Barça Atlètic menos de un mes después de renovar su contrato para unirse al cuerpo técnico de la selección mexicana como asistente de Javier Aguirre.

Durante sus dos temporadas en el Barça Atlètic, Márquez clasificó al equipo para el playoff de ascenso a Segunda División en dos ocasiones. En la temporada 2025/26, el filial alcanzó las semifinales y fue eliminado por el Córdoba, mientras que en la campaña anterior cayó frente al Real Madrid Castilla en la misma instancia. Márquez también contribuyó al desarrollo de jugadores como Pau Cubarsí, Marc Bernal y Gerard Martín.

En su nuevo rol con México, Márquez tiene un papel activo en la preparación diaria del equipo en el Mundial 2026, donde México ha ganado sus cuatro partidos sin encajar goles. El entrenador Aguirre señaló: «Rafa viene a aprender, pero también a aportar. No viene de adorno. Su evolución es enorme, hoy ya se nota que es el entrenador».

Desde un principio se pensó que Márquez asumiría como entrenador principal tras la participación de México en el Mundial. Mientras tanto, Albert Sánchez, antiguo ayudante de Márquez, tomó las riendas del Barça Atlètic.

Este cambio en el cuerpo técnico del Barça Atlètic refleja la estrategia del club de desarrollar su plantilla técnica y colaborar con proyectos internacionales como la selección mexicana.